Авторы базы данных природных углеводов из ИОХ РАН поделились исходниками

5 мая 2022 г.

Одна из крупнейших в мире платформ гликоинформатики — Carbohydrate Structure Database (http://csdb.glycoscience.ru) — развивается на базе Лаборатории углеводов и биоцидов им. академика Н.К. Кочеткова ИОХ РАН с середины 2000-х годов. Она снабжает гликохимиков и гликобиологов опубликованной, производной, смоделированной или предсказанной информацией об углеводах природного происхождения. Хотя ее веб-интерфейс постоянно пополняется новыми функциями, не все можно сделать через Интернет, и существует доля необычных запросов, требующих прямого обращения к данным. С 2022-го года, аннотированные и курированные данные, которыми заполнена база, бесплатно доступны ученым в виде, допускающем самостоятельный анализ. Примеры такого анализа, как и сами данные, теперь можно получить из статьи нового типа – data descriptor — в специальном журнале Scientific Data группы Nature.

Источник:

Philip V. Toukach, Ksenia S. Egorova Source files of the Carbohydrate Structure Database: the way to sophisticated analysis of natural glycans. Sci. Data, 2022, 9, 131. DOI: 10.1038/s41597-022-01186-9.