- Дильман Александр Давидович – д.х.н., проф. РАН, заместитель директора ИОХ РАН по научной работе; заведующий лабораторией функциональных органических соединений ИОХ РАН
- Лысенко Константин Александрович – д.х.н., главный научный сотрудник Лаборатории рентгеноструктурных исследований ИНЭОС РАН
- Новиков Валентин Владимирович - д.х.н., заместитель директора ИНЭОС РАН по научной работе, руководитель отдела физических и физико-химических методов изучения строения веществ ИНЭОС РАН
- Стенина Ирина Александровна – в.н.с., д.х.н. Лаборатории ионики функциональных материалов Института общей и неорганической химии имени Н. С. Курнакова РАН
- Ямпольский Илья Викторович – д.б.н., проф. РАН, зав. лабораторией молекулярной онкогенетики, зам. директора по научной работе Федерального государственного бюджетного учреждения науки Института биологии гена Российской академии наук
- Шаповалов Сергей Сергеевич – (к.х.н., зав. лаб., лаборатория химии обменных кластеров)
- Виноградова Екатерина Викторовна – лауреат премии международного союза химиков (IUPAC);
- Папоян Гарегин (профессор компьютерной биохимии Университета Мэриленда, получил степень под руководством Роалда Хоффмана, выдающегося химика XX века, лауреата НП 1981 года)
- Пидько Евгений Александрович - профессор, Эйндховенский Технологический Университет, г. Эйндховен, Нидерланды
- Исмагилов Рустем Флюрович - Assistant Professor in Chemistry at the University of Chicago
- Науменко Олеся Игоревна – выпускница ВХК РАН 2018 (по итогам конкурса 2018 года присуждена медаль Российской академии наук в области физико-химической биологии за выпускную квалификационную работу «Структурно-генетическая характеристика О-специфических полисахаридов (О-антигенов) Escherichia albertii»).
Ежегодно Государственная Аттестационная комиссия отмечает общий высокий научный уровень представленных работ: разнообразие используемых подходов и методов исследования, широту затронутых проблем, общую эрудицию выпускников ВХК РАН, их высокую квалификацию, сформировавшуюся благодаря специфике существующего учебного плана. Дипломные работы содержат большой объём научных исследований. Комиссия отмечает большое число публикаций (статей и тезисов докладов) у выпускников.
