Исследователи ИОХ РАН создали базу данных гликозилтрансфераз

8 февраля 2021 г.

Гликозилтрансферазы — объект протеомики, важный для понимания работы клеток на молекулярном уровне. Большинство известных активностей предсказано методами биоинформатики, однако огромную значимость в гликологических, иммуннохимических и прочих исследованиях имеют экспериментально подтвержденные ферментативные активности. В рамках систематической работы по информатизации гликомики ученые ИОХ РАН (лаборатории 21, 30, 35) разработали базу данных подтвержденных гликозилтрансфераз и поместили в нее практически все опубликованные на 2020-й год данные по одному наиболее изученному организму каждого из трех царств (бактерии — E. coli, грибы — S. cerevisiae, растения — А. thaliana). Около 2000 записей включают активность трансфераз, структуры доноров, субстратов и углеводных продуктов, ссылки на гены и ферменты в других базах, таксономическую и библиографическую привязку, уровень достоверности установления активности. Поиск данных по нескольким критериям свободно доступен на сайте http://csdb.glycoscience.ru/gt.html.

Источник:

K.S. Egorova, N.S. Smirnova, Ph.V. Toukach CSDB_GT, a curated glycosyltransferase database with close-to-full coverage on three most studied non-animal species Glycobiology, 2021, accepted manuscript. DOI: 10.1093/glycob/cwaa107.