РУС ENG
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Российская Академия Наук

Лаборатория углеводов и биоцидов им. академика Н.К. Кочеткова (№ 21)

д.х.н. Верещагин Анатолий Николаевич
Заведующий: д.х.н. Верещагин Анатолий Николаевич
ORCID: 0000-0001-8675-4943 Researcher ID: M-4057-2016 h-index = 23
Основные направления исследований

Группа изучения бактериальных полисахаридов

  • изучение строения, биосинтеза и возможностей использования полисахаридов клеточной стенки и капсулы важных в медицинском отношении бактерий (Escherichia, Shigella, Yersinia, Enterobacter, Acinetobacter) и фитопатогенных микроорганизмов (Pseudomonas, Pantoea, Pectobacterium). 
  • изучение механизмов расщепления бактериальных полисахаридов деполимеразами бактериофагов – потенциальными антибактериальными агентами.
  • cинтез конъюгатов на основе олигосахаридных фрагментов бактериальных полисахаридов как потенциальных вакцин.
  • разработка новых методов структурного анализа сложных природных углеводов.

 

Группа гликоинформатики

 

Группа работает в новой области знания – гликоинформатике, ее усилия направлены на обеспечение науки об углеводах всей мощью современных компьютерных технологий, предоставление ученым легкого доступа к знаниям, создание сервисов по обобщению знаний, моделированию объектов гликомики и предсказанию их свойств, разработку необходимых для этого информационных технологий. В числе актуальных направлений работы группы:

  • Платформа гликоинформатики Carbohydrate Structure Database, как основа для веб-сервисов и полная регулярно пополняемая курируемая база данных природных углеводов прокариотического, грибного и растительного происхождения;
  • Курируемая база гликозилтрансфераз трех наиболее изученных видов бактерий, растений и грибов;
  • Концепция, модель химических сдвигов, новый подход к предсказанию спектров и сервис 1D и 2D ЯМР-симуляции углеводов и их производных с беспрецедентной средней точностью 0.6 (13C) и 0.07 (1H) м.д. (GODDESS);
  • Модель и веб-сервис по предсказанию первичной структуры углеводов по неотнесенным спектрам ЯМР и другим легко получаемым экспериментальным данным (GRASS);
  • База данных конформационных карт олигосахаридов, заполняемая на основании мол. динамики, и сервис конформационных расчетов углеводов;
  • Сервис по кластеризации организмов и таксонов на основании схожести их гликомов (альтернативные углеводные деревья жизни);
  • Разработка форматов хранения, обмена и презентации данных в программах, базах и статьях, в том числе углеводной нотации CSDB Linear и схемы визуализации Symbol Nomenclature for Glycans;
  • Многочисленные редакторы, конвертеры, статистические анализаторы и прочие сопутствующие сервисы, включая сложные виды поиска данных по множеству критериев и визуальный онлайн-редактор  углеводов с функцией 3D-моделирования структуры и экспортом во всевозможные форматы.

 

LogoБольше информации о работе группы и создаваемых продуктах и сервисах можно найти по ссылкам:

портал Carbohydrate Structure Database: http://csdb.glycoscience.ru

сообщество “Гликоинформатика” в Контакте: http://vk.com/glyco

публикации группы по теме гликоинформатики: http://csdb.glycoscience.ru/help/credits.html#refs

лекция «Информатизация гликохимии и гликобиологии»: http://toukach.ru/rus/glycoinf.htm

Контакты руководителя группы: д.х.н., доцент, в.н.с. Ф.В. Тоукач +7 916 1724710 (звонки и whatsapp), http://toukach.ru/rus

 

Группа изучения биоцидов

 

  • синтез новых типов биоцидов, в частности четвертичных аммониевых соединений (ЧАС), обладающих антибактериальным, противогрибковым и антивирусным действием;

  • изучение зависимостей структура – биологическая активность, направленный синтез таргетных молекул;

  • создание новых антисептических составов на основе соединений-лидеров.

 

Избранные публикации последних лет
Новости института
ИОХ РАН – 90 лет! ИОХ РАН – 90 лет!
23 февраля Институт органической химии имени Н. Д. Зелинского РАН отмечает свое 90-летие. На протяжении всего этого времени Институт является ведущим научным…
Студент лаборатории азотсодержащих соединений ИОХ РАН победил в Студенческом межвузовском конкурсе-конференции, посвященной 190-летию со дня рождения Д.И. Менделеева Студент лаборатории азотсодержащих соединений ИОХ РАН победил в Студенческом межвузовском конкурсе-конференции, посвященной 190-летию со дня рождения Д.И. Менделеева
Конкурс проходил с 11 по 14 февраля 2024 года в Национальном исследовательском университете «Высшая школа экономики». К участию приглашались студенты…
Учеными ИОХ РАН разработан удобный метод сборки насыщенных N-гетероциклических каркасов Учеными ИОХ РАН разработан удобный метод сборки насыщенных N-гетероциклических каркасов
Пирролизидин относится к числу насыщенных N-гетероциклических каркасов, часто встречающихся в природных соединениях и биоактивных веществах. Производные…
Сотрудник ИОХ РАН выступил с докладом на Форуме национальных достижений Сотрудник ИОХ РАН выступил с докладом на Форуме национальных достижений
17 февраля на ВДНХ состоялся Форум национальных достижений в рамках работы Международной выставки-форума «Россия». Со своим докладом «Экологично и просто:…
Преобразование химического мира: эффективный и селективный синтез на свету. Ученые ИОХ РАН предложили новую методологию эффективного и селективного формирования химических связей Преобразование химического мира: эффективный и селективный синтез на свету. Ученые ИОХ РАН предложили новую методологию эффективного и селективного формирования химических связей
Ученые Лаборатории металлокомплексных и наноразмерных катализаторов ИОХ РАН представили универсальный фотокаталитический процесс. Он значительно повышает…
«Если мы не можем что-то победить, можно попробовать использовать это в благих целях»: интервью с Бухтияровым Андреем Валерьевичем, к.х.н, заведующим отделом синхротронных исследований ЦКП «СКИФ» «Если мы не можем что-то победить, можно попробовать использовать это в благих целях»: интервью с Бухтияровым Андреем Валерьевичем, к.х.н, заведующим отделом синхротронных исследований ЦКП «СКИФ»
В ИОХ РАН состоялся доклад Андрея Валерьевича Бухтиярова – «Трансформация активных центров в биметаллических катализаторах под воздействием реакционной…

Лаборатория углеводов и биоцидов им. академика Н.К. Кочеткова (№ 21) ORCID: 0000-0001-8675-4943 Researcher ID: M-4057-2016 h-index = 23 ST LUCE https://zioc.ru/ 5 100 .00 RUB http://schema.org/InStock